Un commissaire à la fusion apprécie la valeur des apports et la parité d'échange, et remet un rapport aux associés. Les associés peuvent, sous conditions, décider à l'unanimité de s'en passer.
Selon les cas : rapport sur la suppression du droit préférentiel de souscription dans les SA et les SAS, certificat du dépositaire remplacé par celui du commissaire aux comptes pour une libération par compensation de créances, ou commissaire aux apports pour un apport en nature.
Pour verser un acompte avant l'approbation des comptes, la société doit disposer d'un bilan intermédiaire certifié par un commissaire aux comptes, qui fait apparaître un bénéfice distribuable.
Dans les SA et les SAS, le commissaire aux comptes fait connaître son appréciation sur les causes et les conditions de la réduction.